凍干機(jī)是由箱體、冷阱、真空系統(tǒng)、壓塞系統(tǒng)、控制系統(tǒng)、制冷系統(tǒng)、清洗系統(tǒng)、加熱系統(tǒng)、滅菌系統(tǒng)等組成。其中凍干機(jī)的箱體及冷阱屬于凍干機(jī)的主要組成部分，是在前期設(shè)計(jì)決定后，后期無法更改的。因此在選擇凍干機(jī)時(shí)首先考慮的是凍干機(jī)的凍干箱與冷阱的形式。
凍干機(jī)的凍干箱與冷阱的形式，可以分為箱阱一體式和箱阱分離式，其中箱阱分離式的和箱阱一體式的升華效率差別很大。
箱阱一體式的凍干機(jī)，效率非常高，成本相對(duì)來說比箱阱分離式的同樣大小的要便宜一些。對(duì)于研發(fā)凍干機(jī)的凍融一體式凍干機(jī)的效率高，產(chǎn)品的性能沒有影響，只要是找到關(guān)鍵溫度，獲得合適的晶型結(jié)構(gòu)就可以進(jìn)行擴(kuò)大生產(chǎn)。
對(duì)于一些冷熱敏感性的物料應(yīng)該選擇箱阱分離式的凍干機(jī)，因?yàn)橄溱宸蛛x式凍干機(jī)有壓力升測(cè)試，可以判斷凍干終點(diǎn)。但是箱阱分離式凍干機(jī)，由于多了一個(gè)關(guān)鍵的中隔閥，而且必須是可以控制其開度的，因此價(jià)格成本上會(huì)增加不少。
對(duì)于箱阱一體式凍干機(jī)和箱阱分離式凍干機(jī)都可以選擇帶壓塞功能的、硅油循環(huán)加熱的，真空系統(tǒng)的配置都可以選擇國外的。
對(duì)于大型生產(chǎn)型凍干機(jī)的選擇主要是考慮凍干產(chǎn)品的工藝穩(wěn)定性，也就是能考高效安全的獲得需要的凍干制品，防止污染、防止質(zhì)量變質(zhì)，其中防止污染、清潔滅菌等要首先考慮，其次考慮凍干機(jī)補(bǔ)冰的效率、在線壓塞、物料進(jìn)出自動(dòng)化功能等。
對(duì)于采用在位滅菌的凍干機(jī)，如果選用蒸汽滅菌屬于壓力容器，成本相對(duì)來說較高，但是滅菌*，驗(yàn)證容易。而采用VHP滅菌成本相對(duì)來說比較低。不過可能存在殘留問題，滅菌時(shí)間較長(zhǎng)等問題。因此需要結(jié)合情況進(jìn)行綜合考慮。
對(duì)于制藥凍干機(jī)和食品凍干機(jī)由于風(fēng)險(xiǎn)和成本效率的不同，因此大多采用不同的凍干機(jī)，如制藥追求的是質(zhì)量，工藝控制，因此多采用分離式的，而食品凍干機(jī)一般追求的是效率和成本多采用一體式的凍干機(jī)，但是大型生產(chǎn)型凍干機(jī)可以跨形式的設(shè)計(jì)凍干產(chǎn)線，使得成本效率和工藝控制能夠合理的結(jié)合。
對(duì)于凍干機(jī)為什么一體式的凍干機(jī)效率高于分離式的凍干機(jī)呢？因?yàn)閮龈蓹C(jī)內(nèi)部升華的蒸汽的流動(dòng)是從飽和蒸氣壓大的地方流向低的地方，而在流動(dòng)過程中的阻力的不同，影響了其效率。分離式的由于通道長(zhǎng)，而且連接處阻力大，因此效率低于一體式的。因此選擇凍干機(jī)的時(shí)候不能一味的覺得分體式的一定要好于一體式的，主要是看做的凍干制品的工藝要求，還有凍干機(jī)的關(guān)鍵因素控制的能力，如板層溫度的均一性，通道設(shè)計(jì)的衛(wèi)生潔凈度，真空極限的設(shè)計(jì)，泄漏率等。
